正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
内外伤寒辩惑论
巢氏诸病源候总论
第1部分第2部分
序卷之一诸中门中风中气中寒中暑中湿中恶厥卷之二诸伤门伤风寒伤暑伤湿伤酒伤食伤食泻卷之三诸气门七气痞塞积聚肿蛊胀香港脚阴气手气小肠气卷之四诸血门鼻衄舌衄肌衄牙宣吐血咯血嗽血小便血破伤血（见疮毒 扑证）大
眼科奇书
编写说明导言一、干支配属（一）天干的阴阳五行属性与方位（二）天干配属脏腑经络与五季（三）天干配属五运（四）地支纪月与所属四季（五）地支所属阴阳五行（六）地支配合时间与脏腑经络二、年、月、日、时干支掌上
序叙自叙御定医宗金鉴麻疹卷一疹原轻重麻疹主治大法麻疹未出证治麻疹见形证治麻疹收没证治卷二身热不退烦渴谵妄喘急咳嗽喉痛失音牙疳呕吐泻泄痢疾腹痛衄血瘙疹盖痘疹瘾疹卷三 （附采诸家麻后证治）麻后龟胸麻后肺痿
序自序凡例节录夏英白先生推拿凡例第一集·认症法审察苗窍五脏各有所司形色部位指南赋以色诊病五视法辨小儿五音闻小儿声音指纹辨色歌以指冷热诊病说以目诊病说五脏所属之症简切辨症法辨舌苔法看病诀寿夭辨小儿坏证辨
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一